Фамилия образована от церковнославянского женского имени Ло́та, которое в разные годы входило в многочисленные православные церковные календари, но отсутствует в современных месяцесловах, начиная с 1891 года. Имя  является женской формой мужского имени Лот (см. ЛОТОВ). 

Фамилия по происхождению является притяжательным прилагательным. Русский фамильный суффикс -ин, означающий отчество (матчество) либо принадлежность, добавляется к мужским именам или прозвищам оканчивающимся на -а или -я, замещая окончания, и ко всем женским именам и прозвищам независимо от конечного элемента, замещая конечные гласные и букву -ь, если таковые имеются.

Ударение в фамилии не регламентируется правилами русского языка, поэтому точно его определить затруднительно. Лучше уточнить у носителя фамилии. 

Женская форма фамилии – ЛОТИНА.

ЛОТИН Василий Тимофеевич.

Российская федерация, Самарская область. КНИГА ПАМЯТИ.  Т. 3, стр. 314.   

Читать по теме:

- См. Библиография. 2. Стр. 144.

- См. Библиография. 4. Стр. 332.

- См. Библиография. 6. Часть 3, стр. 223.

- См. Происхождение фамилий. 2.1.3.1., 3.1.