Фамилия является продуктом приведения фамильного антропонима на -цкий МЕСЕЦКИЙ к стереотипу фамилий на -ов МЕСЕЦКОВ, и обе фамилии восходят к церковнославянскому имени Меса (см. МЕСЕЦКИЙ). 

Такая повторная стандартизация характерна для донского ареала русских фамилий, где стремились привести к единому типу фамильных антропонимов  на -ов фамилии с другими конечными элементами.         

Ударение в фамилии не регламентируется правилами русского языка, поэтому точно его определить затруднительно. Лучше уточнить у носителя фамилии.

Женская форма фамилии – МЕСЕЦКОВА.

МЕСЕЦКОВ Митрофан Алексеевич.                     

Участник Великой Отечественной войны.

Читать по теме:     

- См. Библия. 4 Цар. 3:4.

- См. Библиография. 9. Стр. 209.

- См. Происхождение фамилий. 2.1., 2.1.1., 2.2., 2.2.1., 2.6., 2.6.1., 2.6.1.2., 3.2.