Фамилия является продуктом приведения фамильного антропонима на -цкий МОЛЕЦКИЙ к стереотипу фамилий на -ов МОЛЕЦКОВ, и обе фамилии могут восходить к церковнославянским именам Млид и Молия (см. МОЛЕЦКИЙ), что наглядно просматривается на этимологических цепочках их образования: 

МОЛЕЦКОВ < МОЛЕЦКИЙ < МОЛИЦКИЙ < Молид;

МОЛЕЦКОВ < МОЛЕЦКИЙ < Мол < Молия;

МОЛЕЦКОВ < МОЛЕЦКИЙ < Мола < Мол < Молия;

МОЛЕЦКОВ < МОЛЕЦКИЙ < Мола < Молия.

Такая повторная стандартизация характерна для донского ареала русских фамилий, где стремились привести к единому типу фамильных антропонимов  на -ов фамилии с другими конечными элементами.         

Ударение в фамилии не регламентируется правилами русского языка, поэтому точно его определить затруднительно. Ударение в фамилии лучше уточнить у её носителя.

Женская форма фамилии – МОЛЕЦКОВА. 

МОЛЕЦКОВ Егор Ильич.                                       

Участник Великой Отечественной войны.          

Читать по теме:     

- См. Библиография. 6. Часть 1, стр. 218.

- См. Происхождение фамилий. 2.6., 2.6.1., 2.6.1.2., 3.2., 4., 4.1., 4.1.5., 4.1.8., 4.1.11.