Фамилия образована от церковнославянского мужского имени Ни́фонт, которое берёт начало от греческого «нефон, нефонтос» – «трезвый, рассудительный, благоразумный». РПЦ определяет первоисточник образования имени со значением «трезвый» греческого происхождения. 

Фамилия по происхождению является притяжательным прилагательным. Русский фамильный суффикс -ов, означающий отчество либо принадлежность, добавляется к мужским именам или прозвищам, оканчивающимся на твёрдую согласную.

Ударение в фамилии не регламентируется правилами русского языка, поэтому точно его определить затруднительно. Ударение в фамилии лучше уточнить у её носителя.

Женская форма фамилии – НИФОНТОВА.

НИФОНТОВ Геннадий Михайлович.

Российская федерация, Самарская область. КНИГА ПАМЯТИ.  Т. 9, стр. 264.

Читать по теме:

- См. Библиография. 1.  

- См. Библиография. 2. Стр. 167.

- См. Библиография. 3. Стр. 166.

- См. Происхождение фамилий. 2.1., 2.1.1., 3.1.