Фамилия образована от церковнославянского мужского имени Па́па, которое берёт начало от одного из греческих слов: «папас» – «первосвященник», «паппас» – «отец, папа» (на языке детей) или «паппос» – «дед». РПЦ определяет первоисточник образования имени со значением «отец» греческого и латинского происхождения. 

Фамилия по происхождению является притяжательным прилагательным. Русский фамильный суффикс -ин, означающий отчество (матчество) либо принадлежность, добавляется к мужским именам или прозвищам оканчивающимся на -а или -я, замещая окончания, и ко всем женским именам и прозвищам независимо от конечного элемента, замещая конечные гласные и букву -ь, если таковые имеются. 

Ударение в фамилии не регламентируется правилами русского языка, поэтому точно его определить затруднительно. Лучше уточнить у носителя фамилии. 

Женская форма фамилии – ПАПИНА.

ПАПИН Иван Веденеевич.

Российская федерация, Самарская область. КНИГА ПАМЯТИ.  Т. 4, стр. 268.

Читать по теме:

- См. Библиография. 1.  

- См. Библиография. 2. Стр. 174.

- См. Библиография. 3. Стр. 174.

- См. Происхождение фамилий. 2.1., 2.1.3., 2.1.3.1., 3.1.