Фамилия является продуктом приведения фамильного антропонима на -ский ФОМСКИЙ к стереотипу фамилий на -ов ФОМСКОВ, и обе фамилии восходят к церковнославянскому имени Фома́ (см. ФОМСКИЙ), что наглядно просматривается на этимологических цепочках их образования: 

ФОМСКОВ < ФОМСКИЙ < Фома;

ФОМСКОВ < ФОМСКИЙ < Фом < Фома.

Такая повторная стандартизация характерна для донского ареала русских фамилий, где стремились привести к единому типу фамильных антропонимов  на -ов фамилии с другими конечными элементами.         

Ударение в фамилии не регламентируется правилами русского языка, поэтому точно его определить затруднительно. Ударение в фамилии лучше уточнить у её носителя.

Женская форма фамилии – ФОМСКОВА.

ФОМСКОВ Никифор Иванович.

Участник Великой Отечественной войны. 

Читать по теме:     

- См. Библиография. 1.  

- См. Библиография. 2. Стр. 226.  

- См. Библиография. 3. Стр. 226.

- См. Происхождение фамилий. 2.6., 2.6.1., 2.6.1.2., 3.1., 4., 4.1., 4.1.4.