Фамилия образована от церковнославянского мужского имени Митрофа́н, которое восходит к греческому «Митрофанос»: «метер/митир» – «мать» + «файно» – «показывать, представлять, являть, обнаруживать». РПЦ определяет первоисточник образования имени Митрофан со значением «матерью явленный» греческого происхождения, некоторые исследователи – со значением «найденный матерью, слава матери». 

Фамилия по происхождению является притяжательным прилагательным. Русский фамильный суффикс -ов, означающий отчество либо принадлежность, добавляется к мужским именам или прозвищам, оканчивающимся на твёрдую согласную.

Ударение в фамилии не регламентируется правилами русского языка, поэтому точно его определить затруднительно. Ударение в фамилии лучше уточнить у её носителя.

Женская форма фамилии – МИТРОФАНОВА. 

МИТРОФАНОВ Пётр Алексеевич.

Российская федерация, Самарская область. КНИГА ПАМЯТИ.  Т. 9, стр. 252.

Читать по теме:

- См. Библиография. 1.  

- См. Библиография. 2. Стр. 160.

- См. Библиография. 3. Стр. 159.

- См. Происхождение фамилий. 2.1., 2.1.1., 3.1.