Фамилия образована от мужского имени Софоний, которое является производной формой имени Софон: добавление окончания -ий – один из способов формирования нового имени. Имя Софоний – результат многократной поэтапной модификации церковнославянского имени Софония, что наглядно просматривается на этимологической цепочке образования нового имени от прежнего, а от последнего – фамилии: СОФОНИЙ < Софоний < Софон < Софония. Церковнославянское имя Софония восходит к греческому «Софонис», заимствованному из древнееврейского «Sefanja»: «sefanja» – «Яхве (бог) спрятал» или «сохранил (бог) Яхве». РПЦ определяет первоисточник образования имени со значением «Господь защищает» еврейского происхождения.

В результате исторического процесса имена и прозвища наших предков постепенно приобрели те стандартные формы, которые мы сейчас называем фамилиями. Однако не все фамилии прошли стандартизацию. И сейчас у русского населения встречаются фамилии в виде застывших личных имён, отчеств, прозвищ.  

Ударение в фамилии не регламентируется правилами русского языка, но для отличия фамилии от имени или прозвища ударение, как правило, переносят на другой слог. И всё-таки, ударение лучше уточнить у носителя фамилии.

Женская форма фамилии – СОФОНИЙ.

СОФОНИЙ Георгий Николаевич.

Участник Великой Отечественной войны. 

Читать по теме:

- См. Библиография. 1.  

- См. Библиография. 2. Стр. 203.

- См. Библиография. 4. Стр. 236.

- См. Происхождение фамилий. 2.7., 4., 4.1., 4.1.6.