Фамилия образована в результате придания престижности уже сформировавшейся «простонародной», по мнению её носителя, фамилии СОФОНОВ, при этом модный фамильный элемент -ский добавлен к фамилии, уже оформленной фамильным суффиксом -ов. Фамилия СОФОНОВСКИЙ восходит к церковнославянскому имени Софония (см. СОФОНОВ), что наглядно просматривается на этимологических цепочках её образования: 

СОФОНОВСКИЙ < СОФОНОВ < Софон < Софония;

СОФОНОВСКИЙ < СОФОНОВ < Софона < Софония.

Ударение в фамилии не регламентируется правилами русского языка, однако в фамилиях на -ский, как правило,  ударению не подвергается конечный слог. В любом случае ударение в фамилии лучше уточнить у её носителя.

Женская форма фамилии – СОФОНОВСКАЯ.

СОФОНОВСКИЙ Иван Степанович.

Кавалер Ордена Отечественной войны  I степени.

Читать по теме:

- См. Библиография. 1.  

- См. Библиография. 2. Стр. 203.

- См. Библиография. 4. Стр. 236.

- См. Происхождение фамилий. 2.6., 2.6.2., 4., 4.1., 4.1.5., 4.1.11.